Les infections urinaires, le rôle du laboratoire à chaque étape : du recueil au diagnostic
Le laboratoire est essentiel pour diagnostiquer une infection urinaire : recueil des urines, ECBU, antibiogramme… Découvrez chaque étape pour un traitement efficace !
ParDr. Emilie WEIBELBiologiste médical
5 min de lecture

Les infections urinaires, bien que courantes, touchent particulièrement les femmes et nécessitent un diagnostic précis pour un traitement efficace. Le laboratoire d'analyses médicales (ex Bionext) joue un rôle fondamental dans cette prise en charge. Cet article explore les différentes étapes menant au diagnostic des infections urinaires, ainsi que l’importance de cette confirmation médicale.
Le recueil des urines : une étape clé du diagnostic des infections urinaires !
L’objectif est de vérifier si des germes sont présents au sein de la vessie en récoltant les urines qui sont stériles en l’absence d’infection. Le corps humain n’est pas stérile, bien au contraire. En effet, de nombreux germes sont présents naturellement sur notre peau, au niveau génital ou digestif, ce qui peut entrainer des contaminations de l’échantillon au moment du recueil. Il est donc indispensable de respecter certaines étapes afin d’obtenir des résultats fiables et interprétables :
1. Eviter de prendre un antibiotique avant le recueil lorsque c’est possible
2. L’hygiène avant le recueil des urines :
- se laver soigneusement les mains avant le recueil
- Désinfecter la région génitale à l’aide de la lingette spécifique fournis par le laboratoire.
Elle permet d’éliminer efficacement les bactéries naturellement présentes sur la peau, provenant de la flore digestive et donc d’éviter une contamination de l’échantillon par la flore lors du recueil.
3. Recueil de l’urine par 2ème jet :
- Commencer par uriner un peu dans les toilettes puis s’arrêter
- Prendre le pot stérile fourni par le laboratoire et urinez dedans
Ces précautions permettent également de limiter la contamination de l’échantillon par les bactéries de la flore environnante.
4. Conservation de l’échantillon :
Ramenez les urines (température ambiante) le plus rapidement au laboratoire (< 2h) Sinon conservez le pot d’urine au frigo et le ramener le jour même au laboratoire (<12h) Cette étape est cruciale. Ne pas respecter ces délais peut engendrer des problèmes d’interprétation : sous-estimation du nombre de leucocytes et prolifération de certains germes empêchant une interprétation correcte de la culture.
Conseils pratiques :
Il est important de signaler au laboratoire un certain nombre de renseignements (nature des signes cliniques, prise d’un traitement antibiotique avant ou après le recueil des urines …). Ces informations permettent au laboratoire d’interpréter finement vos résultats.
Le laboratoire Bionext fourni au patient des kits complets comprenant le matériel nécessaire à un bon recueil ainsi qu’une fiche récapitulant les étapes les clés du prélèvement et qui vous permet de renseigner vos signes cliniques.
Comment diagnostiquer une infection urinaire ?
Plusieurs examens peuvent être nécessaires :
- La bandelette urinaire parfois réalisée au sein du cabinet médical. Ce sont des bandes imprégnées de certaines substances qui vont réagir avec des composés présents dans l’urine. Elles permettent notamment la détection de la présence de leucocytes et également de nitrites qui sont des marqueurs d’infection urinaire.
Il peut exister de réelles infections urinaires sans nitrites et sans détection de leucocytes sur la bandelette.
Une analyse plus complète et réalisée au laboratoire peut être prescrite dans différents cas de figure : l’examen cytobactériologique des urines (ECBU) qui comprend :
- La bandelette urinaire
- Le sédiment urinaire. Il permet de déterminer le nombre précis de globules rouges et de globules blancs (leucocytes) présents dans les urines. Il permet également d’apprécier la qualité du recueil des urines par la détection des cellules épithéliales. En effet, la présence de nombreuses cellules épithéliales au sein d’une urine est signe d’un recueil de mauvaise qualité.
- La culture urinaire. Elle permet d’isoler le germe responsable de l’infection et donc de réaliser un antibiogramme permettant de déterminer les antibiotiques efficaces conditionnant le choix d’un traitement adapté.
Le diagnostic d’infection urinaire repose sur l’association de signes à la fois cliniques (présence de symptômes) et biologiques (présence de leucocytes, culture positive)…
Ainsi, le laboratoire interprète les résultats obtenus en utilisant l’ensemble des éléments à sa disposition y compris les informations transmises par le patient (signes cliniques, prise d’un traitement antibiotique au préalable…).
En effet, de nombreux facteurs impactent les résultats et donc leur interprétation et ce dès la première étape : le recueil des urines.
En somme, l’analyse d’urine en laboratoire est essentielle pour un diagnostic fiable et un traitement adapté, améliorant ainsi la prise en charge médicale et contribuant à la lutte contre la résistance aux antibiotiques.
Mieux comprendre les résultats de l’ECBU
Le sédiment urinaire :
- Les érythrocytes (globules rouges) : peuvent être présents lors d’une infection urinaire mais ne sont pas spécifiques de celle-ci.
- Les leucocytes (globules blancs) : leur présence est le signe d’une réaction inflammatoire liée souvent à une infection des voies urinaires. La présence de leucocytes dans les urines ne signifie pas infection, car ils peuvent aussi être présents dans des pathologies rénales.
La culture urinaire :
- Culture stérile : absence d’infection urinaire
- Culture positive : infection urinaire ou colonisation urinaire
- Culture polymorphe : contamination des urines par les flores voisines (cutanée, génitale ou digestive). Ce résultat est obtenu en général lorsque les bonnes conditions de recueil ne sont pas respectées.
Prise en charge de l’infection
Lorsque le diagnostic d’infection urinaire est posé, le laboratoire effectue un antibiogramme qui permet de déterminer les antibiotiques efficaces face au germe isolé.
Choisir le traitement adapté en évitant un usage excessif ou inapproprié des antibiotiques permet de limiter l’émergence de bactéries résistantes.
Le laboratoire Bionext a ainsi adapté sa stratégie diagnostique afin d’optimiser les comptes rendus des antibiogrammes en proposant un antibiogramme dit « ciblé » qui consiste à ne faire figurer que les antibiotiques à utiliser en première intention.
Quelques conseils pour gérer une infection urinaire :
1. Traitement
- Suivre la prescription médicale concernant le traitement et sa durée
- Éviter l’automédication
2. Nouvelle consultation médicale
- En cas de persistance de symptômes
- En cas de récidive
- En cas de complications : survenue de douleurs lombaires, fièvre
Conclusion
La réalisation d’un ECBU en laboratoire peut être nécessaire pour confirmer le diagnostic d’infection urinaire, permettant d’identifier la bactérie responsable et de déterminer le traitement approprié. Le laboratoire BIONEXT se distingue par la rapidité et la fiabilité de ses analyses, offrant des résultats clairs sous 24 heures, même avec antibiogramme. Cette efficacité permet aux médecins de choisir rapidement le traitement adéquat, contribuant ainsi à une prise en charge rapide et de qualité des infections urinaires.
Sources et références
-
Haute Autorité de Santé (HAS), France : Recommandations et bonnes pratiques pour le diagnostic des infections urinaires.
-
Hôpitaux Universitaires de Genève (HUG) : Documentation clinique sur les infections urinaires.https://www.hug.ch/sites/interhug/files/structures/medecine_de_premier_recours/documents/infos_soignants/infections_urinaires_arce.pdf
-
Centre Hospitalier Universitaire Vaudois (CHUV) : Instructions sur les analyses de laboratoire.https://www.chuv.ch/fileadmin/sites/dso/documents/Methodes_de_soins/MDS_Prelevement_urine_bacterio_DSO-FT_-Adultes-086_1.0_.pdf
-
Practice guidelines for the management of adult community-acquired urinary tract infections https://doi.org/10.1016/j.medmal.2018.03.005
-
CASFM 2023 Antibiogramme ciblé pour les ECBU à Enterobacterales : Annexe 5 https://www.sfm-microbiologie.org/boutique/comite-de-lantibiograme-de-la-sfm-casfm/
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HAS Lutte contre l’antibiorésistance : les antibiogrammes ciblés dans les infections urinaires, une approche essentielle
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Rémic Référentiel en microbiologie 7ème édition 2022
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Cet article est informatif et ne remplace pas l'avis d'un professionnel de santé.




